該件案例，依我的看法是，該網域名稱(www.bynature.com.tw)並非"主要部分"，僅作為主要部份之說明，因此，不列入商標專用範圍！
換句話說，他若是只有且直接把該網址作商標註冊，可能的結果會是 www com tw 均非專用範圍，但是，該文字"bynature"即有可能取得商標權。(不過，我的看法是他若僅是文字樣式申請註冊，此時有人主張該文字是通常、一般用語，則很可能異議成功！)
從異議下手，讓Taipei101.com無法取得商標專用權固然是一個比較接近正常的方法。
但是，你成功的結果可能也只限在"Taipei , 101, .com 分別不在商標專用範圍"，對於 "Taipei101" 部分，我猜，可能很難成功。
這樣意謂著她仍有 Taipei101 的商標專用，換成網址當然也只會變成Taipei101.com，因為.com是不管有無商標專用權的人都能用的。
可是，這應該和你想的結果有落差吧，對你有利的應該是連Taipei101都不能成為別人的商標專用才對呀！
但是，除非你提出強而有說服力的理由，影響審查員的評定，否則這特取名稱部分應該很難成功。
所以我才會建議大大也用另一種設計，如粗黑或圓體的文字圖樣去遞件，也許你也會拿到Taipei101專用權喔！(只要非近似、通體觀察等判斷不同即可，如此一來換為網域名稱，同樣也是Taipei101.com，你就可以安然握有網址了)
*我記得之前有個版友貼了一個JAVA商標圖樣的，是二個公司分別都有註冊商標，該JAVA圖樣我看了半天感覺只有細體和粗體的不同也都還可以申請(二公司業務範圍不同)*